Oxaloacetato a citrato

Oxaloacetato a citrato
Una vez en la matriz mitocondrial la formación de acetil-coenzima A puede lograrse por la ruta del piruvato y de la beta oxidación de las grasas “que ya hemos visto” así como del catabolismo de los aminoácidos “que veremos en temas futuros”.  

Figura OC-01. El oxaloacetato descrito con la formula de cuñas y barras. Resaltamos la posición de los cuatro carbonos, en rojo está la posición en la que el grupo acetil será integrado después de que el acetil-coenzima A lo transfiera.

El ciclo de Krebs es formalmente denominado como ciclo de los ácidos tricarboxilicos debido a la presencia de ciertas moléculas que sirven de sustrato a la reacción, y que de hecho son muy similares a otro ciclo famoso, el ciclo de Kalvin-Benson de la fotosíntesis.  

Figura OC-02. El producto mas importante es el citrato, se caracteriza por tener dos ramas simétricas resaltadas en verde y azul. Debido a que las moléculas pueden girar de manera aleatoria, cualquiera de las dos puede ser la que ha sido adicionada por la reacción. De manera arbitraria se define el color azul como el grupo acetil adicionado por la reacción.

Sin embargo el nombre es gracioso, en primera no todos los sustratos son ácidos con tres grupos carboxilo como el oxaloacetato, y el segundo ni siquiera son ácidos (en el sentido molecular), son grupos cargados negativamente producto de la disociación del ácido, es por esto se los designa con la terminación de los grupos anicónicos (-ato)  

Figura OC-03. Acetil-coenzima A, el grupoi a ser transferido se encuentra conectado al azufre tiolico en el extremo izquierdo de la representación.

La primer reacción del ciclo de Krebs es una condensación de aldoles catalizada de manera irreversible por la enzima citrato sintetaza, lo cual nos da una idea del producto de la reacción, que es citrato. Esta es una reacción de reducción desde la perspectiva del citrato ya que su sustrato era una molécula con menor catidad de carbonos y de menor nivel energético.  

Figura OC-04. Estructura cristalina de la enzima sctrato sintetaza.

Los ingredientes son agua, acetil-coenzima A el primero indispensable para la química de la reacción, y el segundo siendo un portador de energía gracias a una transferencia de grupo. El otro ingrediente que sirve como sustrato es una molécula orgánica de 4 carbonos llamada oxaloacetato.
De esta manera la reacción en sí, se puede describir como una transferencia de grupo con una condensación de agua en la que se incrementa el número de carbonos del sustrato (4C) a (6C) con una transferencia implícita de energía.  PRINCIPAL REGRESAR