La serie está dirigida al público adulto dada su cantidad de escenas de gore, violencias y desnudos. Asímismo, guarda cierta similitud con la serie Chobits.
Todo comienza cuandlo Lucy, la más temida de los diclonius, se escapa del laboratorio donde la han tenido varios años experimentando con ella. Claro está, para llevar a cabo su huída no deja títere con cabeza y mata a todo aquel que se le acerque, ya que los cuernos son unos vectores con los que puede rajare-matar a su antojo. Esa misma noche. Kota, un chaval huérfano se encuentra con Lucy, pero no es la Lucy despiadada de antes, sino una chica ingenua y divertida que sólo sabrá decir NIU. Así que Kota se la llevará a casa para cuidarla. A Kota también se le unirá Yuka, una antigua amiga de la infancia que siempre ha estado enamorada de él, y la número 7- - Nana, otra diculonius que tendrá como misión acabara con Lucy. Pero las cosas del destino son caprochosas y el tiempo hace que la número 7- Nana acabe conviviendo con Lucy-Niu, Kota, Yuka y Mayu, una niña con un pasado súper triste (su vida es un dramón, al igual que la vida de Kota) que sólo cuenta en la vida con la compañía de un perrito llamado Wanda.
Este es el argumento principal de Elfen Lied, una serie corta que consta de 13 episodios de veinte minutos cada uno.
El argumento está bien pero hay momentos de la serie que se hace lento y se hecha de menos más acción y protagonismo de Lucy, por lo menos para mí. El final está bien, pero como siempre dejan un halo de duda, puede que hayan dejado el final abierto a una segunda temporada.