Estructura del fotosistema II. Parte superior.

Estructura del fotosistema II. Parte superior.
Aunque originalmente no existe un sentido de arriba o abajo, estableceremos un marco de referencia vinculado al modo en que se representa a la cadena de transporte de electrones de la fotosíntesis en todos los esquemas que he visto. Así siempre está “abajo” el lumen o interior del tilacoide y siempre está “arriba” el estroma del cloroplasto, así que esa será la dirección sobre la cual estableceremos de aquí en adelante la orientación de nuestras palabras.
Es decir, para saber ubicarnos en los mapas de las representaciones de las reacciones lumínicas diremos que, el centro del fotosistema es el centro de reacción fotosintético, la parte de arriba es la mitad que da hacia el estroma y la parte de abajo es la que termina hacia el lumen.
El fotosistema no es solo un grupo de moléculas de clorofila, es un complejo de proteínas con varios grupos prostéticos de importancia.

Figura EF2-01. Estructura completa del ftosistema II, "arriba" estroma, "abajo" lumen. La región de la antena se encuentra hacia arriba, mientras que el dominio que degrada el agua y sintetiza el oxígeno molecular está abajo., en el centro se encuentra una serie de aceptores/donantes de electrones. El proceso de flujo de electrones empieza en el centro de reacción que realiza un proceso doble, al activarse empuja un electrón hacia la parte de arriba del fotosistema, y al mismo tiempo genera un efecto de atracción hacia electrones que provienen de la parte inferior del fotosistema.

El proceso inicia con la extracción de electrones desde el agua “rompiéndola en el proceso”, y termina con la deposición de estos electrones en una molécula llamada plastoquinona “PQ a PQ^-2”
Los eventos comienzan  con la absorción de luz por parte de los pigmentos de la antena en el complejo de captura de luz externa (LHCII). La energía es transferida desde LHCII a través de la antena interna que sirve conector hacia el centro de reacción “P680” de clorofila a, donde cada una de las 4 moléculas están cercanamente unidas. El dímero P680 y otras dos moléculas de clorofila a accesorias.
Como ya se ha mencionado anteriormente, cuando la energía impacta de P680 un electrón es emitido con alta energía hacia un aceptor “o más bien una cadena de aceptores”. El  primer aceptor se denomina feofitina “Pheo”, la cual es una molécula de clorofila que carece del centro de magnesio II.
El segundo aceptor de electrones es la plastoquinona A (PQ_A) ubicado en el estroma del tilacoide. Posteriormente avanza hacia un grupo prostético de hierro “no insertado en un grupo hemo”.
El siguiente aceptor de electrones es la molécula móvil llamada plastoquinona B (PQ_B) que no hace parte integral del fotosistema II, es decir, PQ_B puede salir o ingresar del fotosistema II dependiendo de si está oxidado o reducido. PQB ingresa al fotosistema II oxidado “sin el par de electrones energéticos”, en el fotosistema II se le transfieren los electrones uno por uno desde el hierro prostético.
Una vez que los dos electrones han sido cargados en PQ_B, dos protones ingresan desde el estroma formando PQ_BH₂, en este punto esta molécula abandona el fotosismeta II. PQ_B es apolar, por lo que al salir del fotosistema ingresa en la membrana del tilacoide.