Los restos arqueológicos más antiguos pertenecen a tribus prehistóricas que habitaron zonas del actual término municipal y su presencia se constata por medio de útiles de piedra o sílex que se han encontrado asociadas a los cauces de algunos de los arroyos del municipio.
Los primeros indicios de grandes civilizaciones los encontramos ya en el siglo II aC, cuando los romanos dejaron constancia de su presencia y tránsito, con la aparición de restos de minas de hierro y otros metales en distintos lugares del monte público que debieron tener mucha importancia entonces y que se pueden observar todavía.
Ya en el siglo XIII se construyó una torre defensiva en teoría por habitantes de un núcleo de población establecido en las proximidades del actual municipio, para defenderse de posibles ataques de bandoleros o musulmanes muy frecuentes en aquella época; se cree que alrededor de esta torre comenzarían los primeros asentamientos de población que luego darían lugar al municipio de San Pablo de los Montes. Esta torre después se reconvertiría en campanario de la actual iglesia parroquial de la localidad.
Fueron las gentes de dicho pueblo las que construyeron una pequeña ermita (Ermita de la Fuente Santa) sobre la fuente de la aparición, para guardar la imagen aparecida y darle culto. Se cree que la ruta de peregrinación forjada a partir de entonces pudo contribuir a la aparición y consolidación de San Pablo de los Montes, de ahí el gran arraigo y veneración que los habitantes del municipio profesan a nuestra Virgen de Gracia.http://www.aytosanpablodelosmontes.es/historia.aspx