Atahualpa
Las razones para la rápida conquista de Perú se deben por un lado a la superioridad tecnológica y por otra a las artimañas utilizadas por los conquistadores que aprovecharon la guerra civil en que estaba sumido el imperio Inca entre los dos hermanos Atahualpa y Huascar . El artífice de la conquista fue Francisco Pizarro como todas fue una conquista guiada por la codicia y la rapiña.
Pizarro tenía una encomienda en Panamá. El sacerdote Las Casas le califica como un hombre tosco y analfabeto, poco dado a las mujeres y la bebida pero aficionado al juego. En Panamá se asocio con otro soldado, Diego de Almagro , y con el religioso Hernando de Luque para que financiara la expedición. En 1524 realiza su primer viaje hacia el sur mientras sus dos socios se quedan en Panamá. Esta primera expedición fue un fracaso del que solo quedaron con vida menos de la mitad de los expedicionarios. Estos recibieron refuerzos de Almagro , que era un hombre con mala salud, había perdido un ojo en una batalla y tenía la sífilis. Llegados los refuerzos continuaron hacía la desembocadura del río San Juan , una tierra pantanosa con arenas movedizas, serpientes venenosas e indios antropófagos. Almagro marchó a Panamá una vez mas en busca de refuerzos y a su regreso capturaron a algunos indígenas , entre ellos dos niños a los que bautizaron como Manuel y Felipillo, que a partir de entonces les servirían como interpretes.
Una vez mas Almagro regresa a Panamá en busca de mas refuerzos y a su regreso lleva la orden del gobernador de dar por finalizada la expedición. Pero Pizarro no obedece y sigue adelante con trece leales, que mas adelante conseguirían títulos y tierras como premio por su lealtad. Mientras Almagro regresa a Panamá para intentar conseguir del gobernador una prorroga. Después de conseguir algo de oro Pizarro regresa a Panamá y por consejo del otro socio, el padre Luque, se dirige a España para intentar conseguir del rey Carlos V la autorización para proseguir la conquista, la cual consigue en 1529. El monarca le nombra gobernador y capitán general de Perú , a Almagro gobernador de Túmbed y los 13 leales son nombrados hidalgos.
Francisco Pizarro
A su regreso de España se organiza la nueva expedición en 1531 . En este momento había acabado la guerra civil desatada en el imperio inca a la muerte de Huayna Capac que había dividido el imperio entre los hermanos Atahualpa y Huascar. El primero tras una cruenta guerra había derrotado y hecho prisionero a Huascar. El inca había establecido su corte en Cajamarca, a medio camino entre Quito y Cuzco, aquí esperaba a los españoles, pero al acercarse estos abandono la ciudad y se refugió en un cerro cercano. Los españoles contaban con 62 jinetes, 106 soldados de infantería, , 20 de ellos ballesteros y 6 arcabuceros,así como perros de guerra muy fieros y temidos por los indios. Por su parte los mensajeros los incas contaban unos 30.000 guerreros.Una vez tomada la vacía ciudadela Pizarro decidió engañar a los incas para atraerlos a una trampa. Mandó un mensaje a Atahualpa en el que le invitaba a acudir diciéndole que sería bien recibido, mientras disponía la caballería en tres escuadrones que a una señal dada debían confluir hacía el centro de la plaza, los arcabuceros y falconetes se situaban en lo alto del templo del sol. Cuando Atahualpa y su séquito entraron se extrañaron al ver la plaza vacía, entonces se le acerco solo el clérigo Vicente Valverde con una Biblia en la mano y una cruz en la otra. Felipillo le tradujo que el Papa de Roma había concedido aquellas tierras al rey de España, Atahualpa furioso tiró la Biblia y en ese momento los arcabuceros empezaron a disparar; los indios asustados intentaban huir, así muchos murieron asfixiados, aplastados y pisoteados, otros a manos de la caballería que empezó a atacarlos. Se produjo una matanza espantosa en la que perecieron miles de indígenas, solo algunos lograron escapar.
Atahualpa fue hecho prisionero y Pizarro permitió a sus soldados que escogiesen las indias que quisieran para su servicio. Pocos días después murió Huascar , seguramente por orden de Atahualpa para evitar que aprovechando la situación le quitara el trono. A pesar de estar prisionero era tratado como un príncipe y al observar la codicia de los españoles ofreció a Pizarro una habitación llena de oro y otra de plata si era liberado. Pizarro acepto y así los indios que aún obedecían a Atahualpa empezaron a llevar objetos de oro y plata que posteriormente los españoles fundieron para hacer lingotes. Pero lejos de cumplir su promesa Pizarro consintió que Atahualpa fuese juzgado por una falsa acusación de traición (le acusaron de preparar una rebelión , lo cual era falso) y por la abominación de casarse con sus hermanas. En un gesto de “generosidad” le ofrecieron que si permitía ser bautizado su muerte sería por garrote en vez de ser quemado vivo. Atahualpa aceptó y así tras su conversión fue ejecutado.
La encerrona de Cajamarca
Pizarro se dio cuenta que con su ejecución destruía la base de su autoridad y sembraba el descontento entre los incas. Por eso nombró Inca a otro hijo de Huayna Capac , a Toparca, y con unos 600 españoles y varios miles de auxiliares se dirigió a Cuzco, donde entró el 15 de noviembre de 1533 saqueándola a conciencia.
Poco después murió Toparca y se eligió a otro hijo de Huayna Capac , en esta ocasión a Manco quien ayudo a Pizarro a derrotar al último general rebelde de Atahualpa. En 1533 Pizarro decidió trasladar la capital a un lugar cercano al que llamó Ciudad de los Reyes , futura Lima, y aquí murió finalmente acuchillado por sus propios hombres en 1541.
Tupac Amaru, el último Inca.
Pero la lucha aun no había acabado: Manco se sublevo y llego a sitiar Cuzco. Su hermano Tupac Amaru continuo la lucha desde la fortaleza de Vilcabamba , a unos 35 Km. De Machu Picchu, hasta 1571. La última resistencia fue la protagonizada por Tupac Amaru II, tataranieto del anterior, en 1780, pero fue derrotado y ejecutado al año siguiente.