Desde un punto de vista naturalista, Alta Murgia se caracteriza por la presencia de dos hábitats prioritarios: el Festuco-Brometalia (formaciones herbosas semi-naturales secas y facies cubiertas de arbustos sobre sustrato calcáreo) y Thero-Brachypodietea (césped y plantas anuales). La vegetación cambia según el área: el área es una sucesión de formaciones rocosas, vastas extensiones de estepas y formaciones de bosques, que consisten principalmente en robles(N.Martino / Panda Photo) para los cuales prevalece la forma de gobierno Simple y matriculado. En el territorio del Parque también hay plantas de origen artificial predominantemente de pino carrasco que provienen de las actividades de reforestación iniciadas desde la década de 1930 y que han conducido, con el tiempo, a la solución del problema de la defensa del territorio.
Las formaciones forestales más difundidas están constituidas principalmente por especies quercine. De gran importancia es la presencia de robles ( Q. pubescens L.), sino también de la encina ( Q. ilex L.), de roble ( P. Cerris L.), el roble espinosa ( Q. coccifera Roble L.) de Palestina ( P. calliprinos Webb) de farnetto ( P. frainetto Ten.) y la Fragno raras ( Quercus trojana Webb) y la maleza que consiste en madreselva ( Lonicera sp.), espino albar ( Crataegus monogyna Jacq.) y numerosas especies herbáceas y arbustiva incluyendo peonía ( Paeonia mascula L. Mill.), clemátide (Clematis flammula L.), la rosa de San Giovanni ( Rosa sempervirens L.), rosa silvestre ( Rosa canina L.), gigaro ( Arum italicum Mill.) Cyclamen ( Cyclamen hederifolium Aiton).
Ellos también son populares plantas artificiales prevalencia de pino carrasco. Se llevará a cabo la reforestación de unos cincuenta años a partir de 1930, que implica, por una superficie de alrededor de 25.000 hectáreas, de las zonas del interior y bandas Puglia costeras.
Los bosques de pinos están constituidas principalmente por pino carrasco ( Pinus halepensis Mill.) Y el ciprés común ( Cupressus sempervirens L.) con sotobosque de roble y coccifera, lentisco ( Pistacia lentiscus L.) y ilatro ( Phillyrea sp.). Las zonas de estepa se caracterizan por una vegetación herbácea que incluye especies prioritarios como stipa ( Stipa austroitalica Martinowsky) y numerosas especies de orquídeas pertenecientes a los géneros Serapias , Orchis y Ophrys incluyendo la especie, recientemente descubiertos, llamados Ophrys murgiana .
La vegetación arbórea-arbustiva caracterización de los pastos naturales consiste en oliva ( Olea europaea var. Sylvestris L.), almendra ( Amygdalus communis L.), Marruca ( Paliurus bífida christi Mill.), Níspero ( Mespilus germanica L.), endrina ( Prunus spinosa L.), pera salvaje ( amygdaliformis Pyrus ), almendra silvestre ( Prunus webbii Spach), espino ( Crataegus monogyna Jacq.), ramno ( Rhamnus saxatilis Jacq.).