La capa que va sobre Gnome 3 fue bautizada “Mint Gnome Shell Extensions” (MGSE), y fue desarrollada por el equipo de Mint, encabezado por Clement Lefebvre. Si lo prefieres, también se puede desactivar MGSE para usar Gnome 3 tal como es, o bien seleccionar algunas de las características de MGSE para personalizar el escritorio como uno prefiera.
Adicionalmente, para quienes no soportan Gnome 3 ni con MSGE encima, Mint incluye soporte para MATE, un fork de Gnome 2 que es compatible con Gnome 3. Sin embargo, se trata de un proyecto nuevo y tiene varios conflictos con Gnome 3, de modo que no está funcionando bien por el momento, presentando varias fallas.
Mint ha ganado mucha popularidad últimamente por esta idea de crear una nueva alternativa que acomode a quienes usaban Gnome 2 y que no están satisfechos con la propuesta de Gnome 3. Por otro lado, muchos usuarios de Ubuntu desertaron este sistema operativo por la inclusión de Unity, lo que ha hecho que aumentara el interés por las alternativas.
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