Las flores deben sus colores a pigmentos, es decir,a sustancias naturales coloridas.
El pigmento de las hojas es la clorofila. Aparte de la clorofila, las plantas tienen 2 tipos de pigmentos que se pueden clasificar en dos categorías: los amarillos y los lilas.
-El pigmento amarillo: Este tipo de pigmentos, las xantofilas ofrecen una paleta de colores que va desde el amarillo pálido hasta el rojo casi marrón. Contra más elevada es la concentración de estos pigmentos, más oscuro es el color de la flor.
-El pigmento lila: Este tipo de pigmentos, las antocianinas, ofrecen una gama de colores que cubre todos los tonos de azul, malva y lila. La presencia de antocianinas es típica de las de las petunias. Una fuerte concentración de estos pigmentos da una flor de color lila.
La mezcla de dos tipos de pigmentos dentro de una misma flor es un fenómeno raro. En general, una planta tiene o bien xantofilas o bien antocianinas. Por eso las flores de color marrón son tan poco frecuentes. De hecho, los insectos polinizadores no las detectarían.