De acuerdo a Capcom, los juegos de Mega Man que fueron lanzados para el GameBoy, serán lanzados para el Nintendo 3DS Virtual Console. Los mismos son: Mega Man II, III, IV y V. Los mismos serán lanzados pronto en el Nintendo 3DS eShop.
Además de los juegos antes mencionados, Mega Man Xtreme 1 y Mega Man Xtreme 2 también serán lanzados en el Nintendo 3DS. Los mismos son unos "remix" de la versiones de SNES (Mega Man X y Mega Man X2. Las fechas de lanzamiento de los juegos será anunciadas más tarde.