Quarantine 2: Terminal arranca justo después de los acontecimientos vistos en la película anterior en LAX, con los pasajeros a bordo de un vuelo a Nashville. Cuando un pasajero cae gravemente enfermo y se transforma por culpa de un virus misterioso, con algo parecido a la rabia, el avión realiza un aterrizaje de emergencia en un aeropuerto de una gran metrópolis. Jenny (Masohn), auxiliar de vuelo pero sin experiencia, se encargará de la seguridad de sus pasajeros.
Aliviada cuando ve llegar una buena cantidad de vehículos de emergencia, unidades de policía y todo tipo de auxilio, Jenny y los pasajeros descubren rápidamente que han sido puestos en cuarentena y se encuentran atrapados. Desesperada por escapar, Jenny recluta a uno de los pasajeros que han sobrevivido, Henry (Cooke), para idear un plan para salir adelante.
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