Smith, que previamente había trabajado en Jordan, Red Bull, Force India y Caterham, se unió a Sauber como Director Técnico el pasado mes de julio, el primero de la escudería desde 2012.
Sauber dice que Smith ha regresado al Reino Unido por motivos familiares.
"Ha dejado la compañía," rezaba un breve comunicado.
"Nos gustaría agradecer el trabajo de Mark y le deseamos lo mejor para su futuro."
Sauber no ha comunicado un potencial sustituto.