Cuando ingresas a ver el Mapa de Nagios puedes escoger diferentes layouts el tema es que al reiniciar la pagina volverás al que Nagios trae por defecto y puede ser que ese no sea tu preferido.
Para escoger un layout por defecto debes editar el archivo /usr/local/nagios/etc/cgi.cfg y buscar el texto siguiente.
default_statusmap_layout=6
Donde el numero al final de la linea indica el layout, te puedes orientar con el siguiente listado.
Value Layout Method 0 User Supplied 1 Depth Layers (Horizontal) 2 Collapsed Tree (Horizontal) 3 Balanced Tree (Horizontal) 4 DO NOT USE 5 Circular Markup 6 Circular Balloon 7 Balanced Tree (Vertical) 8 Collapsed Tree (Vertical) 9 Depth Layers (Vertical) 10 Force Map
Luego de colocar el numero de tu layout de preferencia debes reiniciar el demonio de Nagios y Apache.