Instalar Exchange en un controlador de dominio tiene muchas limitantes, principalmente desde el punto de vista de seguridad y rendimiento.
Exchange requiere Active Directory pero este requerimiento no implica que se deba instalar en un servidor con el rol de controlador de dominio.
La recomendación es instalar Exchange en un servidor miembro del dominio.
En adición, suponiendo el escenario donde Exchange ya se encuentra instalado en un servidor miembro, no es soportado promover este servidor a controlador de dominio y lo mismo a la inversa, es decir, si se instala Exchange sobre un controlador de dominio no estaría soportado que posteriormente se despromueva el rol de DC (demote).
En caso de ser necesario cambiar el rol de un servidor con Exchange instalado, el mecanismo soportado sería generar un nuevo servidor de Exchange, mover toda la funcionalidad, información de buzones, etc y por último desinstalar Exchange en el servidor original.
Por información sobre instalación de Exchange: