Si cuentas con un equipo con Windows instalado podrás haberte topado con la tarea de necesitar des-fragmentar el disco debido a que con el tiempo se ha vuelto un poco lenta debido a la fragmentación que sufren los archivos y te preguntaras porque la gente que tiene Linux o Mac no necesitan des-fragmentar de hecho ni si quiera tienen herramientas para ejecutar esta tarea.
Primero hablemos que es la fragmentación (esto solo sucede en los discos con discos móviles no en los SSDs), cada archivo creado en Windows se crea uno al lado del otro de forma secuencial en el disco duro, cuando borras un archivo y creas uno nuevo este puede ser grabado en ese espacio y si este es mas grande la parte restante se grabara en una posición diferente.
Esto hace que en un disco convencional a la hora que se carga un archivo el cabezal deba moverse de un sitio a otro en el disco para lograr cargarlo lo que al final se traslada en tiempo, con Linux y Mac no sucede esto porque estos sistemas graban los discos de forma esparcida y cuando lo graba cerca deja espacio para crecimiento, y si este se llena mueve el archivo entero a otra posición para que este se grabe de forma completa y no fragmentada.
La buena noticia es que a partir de Windows 7 este sistema hace un des-fragmentación en sus rutinas de mantenimiento automáticas en segundo plano cuando no estas dando mayor uso al equipo, así que raramente vas a necesitar ejecutar esta tarea de forma manual.