Los movimientos de rotación de la columna vertebral al practicar windsurf, y el mantenimiento del tronco inclinado hacia delante en flexión total, sobrecargan especialmente el disco intervertebral. La flexión implica que el núcleo del disco se desplace hacia atrás y la rotación hace incrementar la presión sobre el núcleo del disco. Por todo ello, muchos windsurfistas padecen hernia discal.
Mantener una buena forma física para tener suficiente fuerza en los brazos y así evitar los tirones de espalda y mantener un buen peso es esencial para prevenirla. Además, realizar un buen calentamiento, así como estiramientos, y desarrollar los músculos a nivel lumbar y abdominal son claves para evitar lesiones al practicar este deporte.