Preposiciones en, sobre, encima de: usos y contrastes

Las partículas en, sobre y encima de denotan que el elemento que está delante de la preposición, ocupa una posición superior al término de la preposición o elemento que sigue. Por ejemplo en: Dejé las llaves (en / sobre / encima de) la mesa;el elemento -las llaves- ocupa una posición superior respecto a la mesa, que es el término de la preposición.
Cuándo usar las preposiciones en, sobre y encima dePara diferenciar los usos de en, sobre y encima de hay que tener en cuenta dos factores: la existencia o no de contacto y la situación en el plano horizontal o vertical.
1) Existencia o no de contactoEscribí su número de teléfono en la agenda.Metí la carta en el sobre.La preposición en implica contacto entre el elemento y el término de la preposición, mientras que con las preposiciones sobre y encima de puede haber contacto (a) o no (b) entre los dos elementos:(a) Ha puesto en libro (en / sobre  /encima) de la mesa.(b) * El avión pasó volando en sus cabezas.    El avión pasó volando sobre sus cabezas.   El avión pasó volando por encima de sus cabezas.
La preposición en puede tener también el significado de “dentro de”, mientras que sobre y encima de no pueden tener nunca este significado:He guardado las servilletas en el cajón.* He guardado las servilletas sobre / encima del cajón.
2) Situación de los elementos en el planoCon sobre y encima de al menos uno de los dos elementos tiene que indicar horizontalidad, mientras que con la preposición en ambos elementos pueden indicar verticalidad:En el tablón de anuncios hay un cartel con los horarios.Encima del tablón de anuncios hay un cartel con los horarios.* Sobre el tablón de anuncios hay un cartel con los horarios.
A diferencia de en, tanto sobre como encima depueden indicar posición superior no física, sino figurada:Sobre él / Por encima de él está solamente el director general.
Otros valores de las preposiciones en y sobreAdemás del valor de posición espacial superior, estas partículas pueden tener otros valores y aparecer en otros contextos en los que no son intercambiables.
En de situación:Se ha quedado en casa.* Se ha quedado sobre casa.* Se ha quedado encima de casa.
En temporal:En dos horas estoy allí.* Sobre dos horas estoy allí.* Encima de dos horas estoy allí.
En de manera o medio:Está escrito en francés.Tienes que lavarlo en agua caliente.
Sobre equivalente a “acerca de”:Me ha contado todo sobre él.
Sobre delante de los numerales para indicar aproximación:Volveré sobre las tres y media.
(*) Estructura agramatical