Uso de la coma: ¿antes de “que” o después de “que”?

A veces la coma explicativa va antes del que, porque es pronombre, y a veces la coma va después del que, porque es conjunción  y la acotación comienza después de él.
Que conjunción seguido de coma explicativa
La niña no quiso comer la papilla que, con todo cariño, le había preparado su madre.
En este ejemplo, el error más habitual es colocar la coma antes del que, como si fuera pronombre, cuando en realidad es una conjunción y forma parte de la oración principal y no del inciso explicativo. La forma para comprobar la ubicación de la coma es quitar el inciso y leer la oración que queda: La niña no quiso comer la papilla que le había preparado su madre; la oración es completa y clara.
Que pronombre precedido de coma explicativa
La niña no quiso comer la papilla, que con todo cariño, le había preparado su madre.
Si en este ejemplo retiramos el inciso que con todo cariño, la oración queda incompleta. Este que no es explicativo, sino determinativo y no forma parte del inciso, sino de la parte determinativa de la oración. Por lo tanto el inciso es necesario para que la oración sea clara y completa.