De acuerdo a su significado los prefijos se pueden clasificar en espaciales, temporales, aspectuales, cuantificativos, gradativos y escalares, negativos y de orientación.
Prefijos espaciales
Ante- : antebrazoCircun- : circunferenciaEndo- : endovenosoEntre- : entrepisoExo- : exoesqueletoExtra- : extracorpóreoInfra- : infrahumanoInter- : internacionalIntra- : intramuscularPeri- : pericarpioRe- : reboticaRetro- : retrovisorSobre- : sobrevolarSub- : subsueloSuper- : superponerTras- : trastiendaPrefijos temporalesAnte- : anteayerEx- : expresidentePos(t)- : posmodernoPre- : predemocrático
Prefijos aspectualesRe- : reintentar
Prefijos cuantificativosBi- : bisexualMono- : monoauralMulti- : multipropósitoPluri- : plurianual
Prefijos gradativos y escalaresArchi- : archifamosoCuasi- : cuasidelitoHiper- : hipermercadoInfra- : infravalorarRe- : rebuscarSemi- : semicultoSobre- : sobrecargarSub- : subgerenteSuper- : superinteligenteVice- : vicedirectorPrefijos negativosa- : acéfalo, atemporal, átonoDes- : deshacerDis- : discapacitadoIn- : inepto, intransitable, imposible
Prefijos de orientación o disposiciónAnti- : antinieblaContra- : contraataquePro- : pronuclear
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